circRNA研究汇总

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计24篇,下面我们一起来看看,circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式:(circRNA[Title/Abstract])ORCircularRNA[Title/Abstract]

1、精神病相关的环状RNA控制突触基因的表达和认知。

标题:Apsychiatricdisease-relatedcircularRNAcontrolssynapticgeneexpressionandcognition.

杂志:MolecularPsychiatry

影响因子:11.

通讯作者:NikolaosMellios(新墨西哥大学医学院)

尽管环状RNA(circRNA)富集在哺乳动物的大脑中,但关于其参与脑功能和精神疾病的潜在功能知之甚少。这篇研究中,作者发现一种在额叶皮层神经元中大量表达富集的circRNA——circHomer1a,衍生自Homer蛋白同源物1(HOMER1),在精神分裂症(SCZ)和双相情感障碍(BD)患者的额叶前皮层(PFC)和诱导的多能干细胞来源的神经元培养物中均显著减少。此外,circHomer1a的改变与精神分裂症(SCZ)的背外侧前额叶皮层(DLPFC)和眶额叶皮层(OFC)发病年龄呈正相关。没有观察到SCZ发病年龄和线性HOMER1mRNA之间的相关性,其表达在BD和SCZ死后大脑中基本不变。使用体内circRNA特异性敲低技术敲低小鼠额叶前皮层(PFC)中circHomer1a,结果显示circHomer1a调节了突触可塑性和许多精神病相关基因的可变剪切mRNA的表达。有趣的是,小鼠眶额叶皮层(OFC)中circHomer1a的敲低导致OFC介导的认知灵活性的特定缺陷。最后,作者证明了神经元RNA结合蛋白HuD与circHomer1a结合并可以影响其在额叶皮层中的突触表达。总的来说,该研究成果揭示了一种新型的精神疾病相关的circRNA——circHomer1a调节突触基因的表达和认知的灵活性。

图注:circHomer1a敲低后影响精神疾病和神经相关基因的可变剪切mRNA表达

2、胶质瘤中circ-MAPK4通过海绵吸附miR-a-3p抑制经由MAPK信号通路的细胞凋亡。

标题:CircularRNAMAPK4(circ-MAPK4)inhibitscellapoptosisviaMAPKsignalingpathwaybyspongingmiR-a-3pingliomas.

杂志:MolecularCancer

影响因子:10.

通讯作者:尹东和刘安民(中医院)

神经胶质瘤是中枢神经系统(CNS)中最常见,最具侵略性的原发性恶性肿瘤,环状RNA在其中的作用还有很多未解之谜。在这项研究中,研究者通过生物信息学分析早期神经发育过程中的失调circRNA,筛选鉴定到circ-MAPK4(has_circ_),circ-MAPK4在早期神经分化过程中被显著下调。在神经胶质瘤中,circ-MAPK4作为一种癌基因,被逆向上调并与神经胶质瘤的临床病理阶段有关(P0.05)。最后,体内外实验证实circ-MAPK4在体外和体内均可促进神经胶质瘤细胞的存活并抑制其凋亡。此外,研究者还证明circ-MAPK4参与调节p38/MAPK通路,从而影响神经胶质瘤的增殖和凋亡。miR-a-3p(一种miRNA)通过削弱p38/MAPK途径显示出肿瘤抑制功能,这种抑制作用可通过抑制circ-MAPK4而增强。抑制miR-a-3p可以部分挽救p38/MAPK磷酸化水平的提高和circ-MAPK4敲低诱导的凋亡增加。研究结论表明,circ-MAPK4是通过调节miR-a-3p的p38/MAPK信号通路在神经胶质瘤细胞存活和凋亡中发挥关键作用,可以作为神经胶质瘤治疗的新靶点。

图注:人神经胚状体和神经胶质瘤中circ-MAPK4的表达特征

3、综述:环状RNA数据库的现状和观点。

标题:Closingthecircle:currentstateandperspectivesofcircularRNAdatabases.

杂志:BriefingsInBioinformatics

影响因子:9.

通讯作者:MariekeVromman,Pieter-JanVolders和Pieter-JanVolders(比利时根特大学)

环状RNA(circRNA)与多种疾病(包括癌症)密切关联。但是,大多数circRNA的精确功能和分子机制还不清楚。目前,许多研究者遵循不同的实验和计算方法鉴定circRNA,开发了多个circRNA数据库,为circRNA研究带来了许多便利。但当前的circRNA数据库存在几个主要问题,克服这些问题将大大提高该领域的发展。首先,由于circRNA的低丰度和高度特异性表达,以及各种测序方法,circRNA检测工具和数据分析方法不同,导致circRNA内容重叠,因此缺少真正的circRNA参考集。第二个主要问题是circRNA术语的模棱两可,跨不同数据库的circRNA的冗余名称甚至冲突名称都会导致重现性危机。第三,circRNA数据库本质上依赖于circRNA反向剪接拼接的位置,而选择性剪接可能导致circRNA具有不同的长度和序列。为了唯一地识别circRNA分子,需要完整的环状序列。第四,有些circRNA数据库注释了circRNA的miRNA结合和蛋白质编码潜力,但这些注释通常基于假定的circRNA序列。最后,一些数据库没有定期更新,包含不完整的数据或存在链接问题。在这篇综述中,作者对当前circRNA数据库及其内容,功能和可用性进行了全面概述。除了讨论有关circRNA数据库的当前问题外,作者还提出了一些重要建议。

表注:已有的circRNA数据库简介

参考文献列表

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