目前对于脑膜瘤的分级只基于WHO的组织学分型，缺少分子标志物。在一项基于综合性脑膜瘤的遗传学标志物研究中发现，根据DNA甲基化表达谱，脑膜瘤能分成6个与临床相关的分子组别。与WHO分组相比，分子分组能更准确地对疾病进展进行预判，发现高危组别。
脑膜对整个中枢神经系统起着保护的作用。在胚胎发育时期，脑膜前体细胞起源于中胚层和神经嵴。然而，脑膜细胞可能转化，导致肿瘤发展的开始。这些脑膜瘤是最常见的原发性颅内和脊髓肿瘤。虽然80％的脑膜瘤显示良性临床行为，可以通过单独切除术治愈，约20％复发后切除和需要额外的治疗，如进一步手术，放射治疗或全身化疗。组织病理学评估旨在确定有复发风险的患者。在年的第一个国际公认的分类方法中，Bailey和Cushing鉴别出脑膜上皮，成纤维细胞和血管瘤的亚型，并且到今天，决定亚型的也仅基于组织学发现。现有的WHO分类分为15种亚型和3级恶性肿瘤，但是其中一些诊断标准定义是模糊的，表明需要更可靠的标志物。
对于其他类型的CNS肿瘤，分子表达谱已经鉴定了具有特征性的不同亚型。这些亚型中的许多与预后相关或能提供治疗的目标，因此有助于临床决策——例如，髓母细胞瘤和室管膜瘤中的表观遗传亚组，或弥漫性胶质瘤中的IDH状态。然而，到目前为止，提出的脑膜瘤分子分级方案主要基于细胞遗传学，并且没有进入诊断程序。其他研究调查了在低度和高度脑膜瘤之间不同的特异性甲基化位点，但尚未提出全面的风险分层系统。研究已经确定端粒酶逆转录酶（TERT）启动子突变是脑膜瘤中的一小部分，与更高的复发风险和更短的进展时间有关。然而，这些发现仅涵盖几个脑膜瘤，并且还没有彻底地经过测试其与预后的相关性。
这项研究的目的是脑膜瘤的整个分子遗传学的全面表征，以确定生物和临床相关的亚群。然后可以根据现有的组织学分类，将这些分子亚组合整合到精确分类方案中，以符合由更新后的脑肿瘤WHO分类方法。
该研究从个脑膜瘤的发现队列中分析了全基因组DNA甲基化谱，以及可能在组织学上模拟脑膜瘤变体的，其他个轴外颅骨肿瘤样本，包括孤立性纤维性肿瘤或血管外皮细胞瘤，神经鞘瘤，恶性周围神经鞘瘤，脊索瘤，软骨肉瘤，纤维性发育异常和血管母细胞瘤。其他肿瘤包括胶质肉瘤，平滑肌肉瘤，神经纤维瘤和纤维瘤样病变。这些样品用于测试是否可以根据DNA甲基化情况，能将其他从脑膜发生或浸润的肿瘤从脑膜瘤中分离出来。每个组织样品足以进行甲基化分析和无监督聚类，且能将所有样品分配给一个亚组，没有样品不确定。
尽管都是来自于中胚层，DNA甲基化数据的无监督聚类能清楚地将所有脑膜瘤与其他颅骨肿瘤分离。单独脑膜瘤的无监督聚类显示出两个主要的表观遗传组：A组和B组，进一步细分为A组四个亚组和B组两个亚组。这六个亚组被指定为甲基化分类。上图可以发现WHOI级肿瘤在MCben-1，MCben-2和MCben-3中富集，以及WHOIII级肿瘤在MCmal中富集，WHOII级肿瘤分散在所有甲基化类别中。虽然初始聚类集中在原发性病变，但随后分析了37例患者的原发性和匹配的复发性肿瘤。该分析结果显示，A，B组病例与复发相关性较好，有助于进一步评估甲基化谱的诊断和预后意义。
接下来使用定制的混合捕获下一代测序工具对先前报告为含有53个脑膜瘤突变基因的个脑膜瘤中的个进行了测序。已知的复发性突变（最常见的是NF2，其次是TRAF7和AKT1）在一些甲基化类别中显着丰富。在A组中，在67个MCben-1肿瘤的42例（63％）中观察到NF2突变（在该甲基化类别中显着富集可变，p0.）。在MCben-2亚组的74个肿瘤中，富集了5个突变：AKT1（24[33％]，p0.），SMO（5[7％]，p=0.），KLF4（11[15％]，p0.）和TRAF7[49％]，p0.）。这一组肿瘤很少有NF2突变。在MCben-2外检测到仅一个AKT1突变和五个KLF4突变。MCben-3在47例肿瘤的15例（32％）中显示NF2突变（p=0.）。MCint-A在60例肿瘤的32例（53％）中携带NF2突变（p=0.）。在B组中，20例MCint-B肿瘤（p=0.）和35例MC恶性肿瘤（p=0.）11例（31％）发生7例（35％）NF2突变。SUFU突变局限于B组，其中20个MCint-B肿瘤中的一个（5％）（p=0.）和35个MC恶性肿瘤中的两个（6％）（p=0.）携带这种突变。B组中五个TERT启动子突变中的四个定位于B组脑膜瘤（p=0.，Fisher精确检验）。在整个队列中，样本平均含有2.5个单核苷酸变体（SD2.15）或小缺失或插入（indel），表明相当低的变异频率。
接下来分析了甲基化水平对WHO分级的预测能力，特别是发现队列中的52例患者。WHOI级，分子类型为中间甲基化类别（WHOI级MCint）的脑膜瘤患者的临床疗效优于仅基于组织学诊断的WHOI级脑膜瘤患者。
事实上，这些患者（WHOI级MCint）的结果与WHOII级脑膜瘤患者无差异。类似地，WHOII级脑膜瘤患者分子指定为良性甲基化类别（WHOII级MCben）的结果优于组织学定义的WHO二级脑膜瘤患者的平均结果。因此，甲基化阶段的分层预测无进展生存期比WHO分级具有更高的价值。在联合甲基化类别中，WHO分级没有提供任何附加信息。如何联合甲基化类别在所有WHO级别中划定具有不同预后的亚组，显示了甲基化类对患者的分级的益处，并有可能大大减少治疗不足或过度治疗。
点评基于DNA甲基化的脑膜瘤分类在临床上能鉴别出更均一、更一致性的组，并且具有比WHO分类更高地预测肿瘤复发和预后的能力。这里介绍的方法可能对脑膜瘤患者分组到仅观察或辅助治疗组时非常有用。未来，基于甲基化的肿瘤分类与脑膜瘤的诊断将和治疗高度相关。
责任编辑：肿瘤资讯-宋小编参考文献DNAmethylation-basedclassificationandgradingsystemformeningioma:amulticentre,retrospectiveanalysis
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